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Bestimmen, ob ein spezifisches Prolin im Protein cis oder trans ist?

Bestimmen, ob ein spezifisches Prolin im Protein cis oder trans ist?


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Während Peptidbindungen normalerweise die trans Konformation können Peptidbindungen an Prolin in beiden vorliegen cis oder trans Konformation. Die Isomerisierung zwischen cis und trans ist langsam und hat sich als geschwindigkeitsbestimmender Schritt bei der Faltung bestimmter Proteine ​​erwiesen.

Mit welchen Methoden kann die Konformation eines bestimmten Prolins in einem Protein bestimmt werden?


Sarkar et al. (2007) Prolin-cis-trans-Isomerisierung kontrolliert die Autohemmung eines Signalproteins. Molekulare Zelle 25, 413-426 (DOI 10.1016/j.molcel.2007.01.004), hier verfügbar.

Die Autoren berichten über die Interaktionen zwischen zwei SH3-Domänen des Crk-Adapterproteins. Grundsätzlich stellen sie fest, dass der Linker, der diese beiden Domänen verbindet, ein Prolin enthält, das zwischen den cis und trans Konformationen, und dass diese gegenseitige Umwandlung die Wechselwirkung zwischen den beiden Domänen bestimmt. Sie verfolgen die Isomerisierung unter Verwendung von NMR.

Cis-trans Die Peptidyl-Prolyl-Isomerisierung ist eine subtile Änderung, und ich glaube nicht, dass Sie einen einfacheren Weg finden werden, sie in einem bestimmten Protein zu verfolgen.



Bemerkungen:

  1. Mezimi

    Bei Ihnen eine abstrakte Mentalität

  2. Mwinyi

    Ich bin mir absolut sicher.

  3. Gazsi

    Anstatt zu kritisieren, schreiben Sie die Varianten.

  4. Torisar

    Ich schlage vor, die Website zu sehen, dass es viele Artikel zu diesem Thema gibt.

  5. Rover

    Ich schließe mich all dem an. Wir können über dieses Thema sprechen. Hier oder am Nachmittag.



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