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Rekombinationsfrequenzproblem

Rekombinationsfrequenzproblem


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Drei Loci C, D und E befinden sich in dieser Reihenfolge auf demselben Chromosom. Wir fanden heraus, dass die Häufigkeit von Rekombinanten zwischen C und D 10 % beträgt und zwischen D und E 20 %. Unter der Annahme, dass das Crossing-Over zufällig auf dem Chromosom auftritt, wie hoch ist die erwartete Häufigkeit von Rekombinanten zwischen C und E?

Ich weiß, dass es weniger als 30% (10%+20%) sein sollte, aber die Antwort lautet 26%. Ich verstehe nicht, wie sie das herausgefunden haben.

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Die Rekombinationshäufigkeit beträgt <30% aufgrund der Möglichkeit, dass ein Crossover zwischen C und D und auch zwischen D und E stattfindet. Die Wahrscheinlichkeit dafür beträgt 2% (10/100 X 20/100) Also, warum ist das so? 26% statt 28% ?

Eine andere Möglichkeit: Bin ich total daneben?


Ich habe $26$% als Antwort erhalten.

Um eine Rekombination zwischen C und E zu erreichen, gibt es zwei mögliche Mechanismen:

  1. C und D produzieren eine Rekombinante, aber D und E bleiben verbunden, daher wird der endgültige Genotyp eine Rekombinante sein, wenn man C und E berücksichtigt (Chiasmata zwischen C und D). Hier ist $P_1=P_{CD} imes P'_{DE}$ wobei $P$ die Wahrscheinlichkeit der Rekombination und $P'=1-P$ die Wahrscheinlichkeit der Verknüpfung ist. Daher $P_1=0.08$
  2. C und D bleiben verbunden, aber D und E gehen eine Rekombination ein (Chiasmata zwischen D und E). Hier ist $P_2=P'_{CD} imes P_{DE}=0,18$

Wenn sowohl zwischen C und D als auch D und E ein Chiasmata vorhanden ist, weist das Ergebnis aufgrund des doppelten Crossing-Over keine Rekombination im C- und E-Locus auf. Wenn kein Crossing-Over stattfindet, findet an keinem der Loci eine Rekombination statt.

Die Netto-Rekombinationswahrscheinlichkeit $P_{CE}$ ist die Summe dieser beiden, da jede dieser Möglichkeiten auftreten kann, um eine Rekombination zwischen C und E zu ergeben. $P_{CE}=P_1+P_2=0.26$

Und Biogirllajja, Ihre Berechnung (das Edit) war fast richtig, aber Sie müssen 2$% von sowohl $10$% als auch $20$% abziehen, weil beide die Wahrscheinlichkeit der Überkreuzung an einem Loci beinhalten, einschließlich des Falles, in dem die andere Loci haben sich auch gekreuzt. Daher müssen Sie es von beiden subtrahieren und dann addieren, um 26 $% zu erhalten. Sagen Sie mir, wenn Sie möchten, dass ich meine Erklärung erweitere oder einige Klarstellungen mache.

Wenn wir einfach die Kartenentfernungen addieren, erhalten wir die tatsächliche Kartenentfernung, die die Möglichkeit doppelter Rekombinationen außer Acht lässt. Alle Karteneinheiten, die größer als 10 cM sind, haben signifikante Chancen auf doppelte Überkreuzungen zwischen ihnen, und daher wäre die beobachtete Rekombinationsfrequenz geringer als die erwarteten 0,1. Daher ist die beobachtete Rekombinationshäufigkeit für Entfernungen von mehr als 10 cM nicht dieselbe wie (Kartenentfernung/100).