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Einfache Erklärung eines scharfen Bildschirms oder eines gepoolten scharfen Bildschirms?

Einfache Erklärung eines scharfen Bildschirms oder eines gepoolten scharfen Bildschirms?


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Ich bin mit der Funktionsweise von CRISPR vertraut, um entweder Knockdown- oder Amplifikationseffekte für ein einzelnes Gen zu erzielen, da Sie präzise Schnitte vornehmen können.

Was genau macht ein gepoolter Crispr-Bildschirm und wie funktioniert er?


Im Kontext des gepoolten CRISPR-Screens entwerfen Sie zunächst eine Bibliothek von gRNAs gegen einen bestimmten Satz von Zielen (anstelle nur eines Ziels).

Die Bibliothek kann die gewünschte Größe haben, meistens zielt sie entweder auf das Kinom oder das gesamte Genom (genomweit) ab. In diesem Zusammenhang würden Sie die vollständige Bibliothek zu Ihrer interessierenden Zelle hinzufügen, in der Sie die Störungen vornehmen möchten.

Je nachdem, wie der Bildschirm eingerichtet ist, versuchen Sie, die Störungen auszuwählen, mit denen Sie entweder einen Auswahlprozess passieren können (Toxizität, Fluoreszenzanzeige usw.). Normalerweise ist es ein eleganter Weg, entweder ein Etikett mit einem Barcode zu versehen, der Ihnen hilft, die gRNA zu identifizieren, die den überlebenden / ausgewählten Phänotyp erzeugt hat. Mit dem Barcode/gRNA können Sie nachverfolgen, welches Gen beim Screening wahrscheinlich gestört wurde.

Ich hoffe, das hilft und beantwortet Ihre Frage. Bitte zögern Sie nicht, es weiter zu verfeinern, wenn Ihnen dies nicht klar ist.



Bemerkungen:

  1. Xuthus

    Bravo, großartige Idee und ist ordnungsgemäß

  2. Fenrizilkree

    JA, die gute Variante

  3. Lindel

    Sicherlich. Ich habe mich ganz oben erzählt. Lassen Sie uns diese Frage diskutieren. Hier oder in PM.

  4. Rayner

    Es war auch bei mir. Lassen Sie uns dieses Problem diskutieren.

  5. Yozuru

    Meiner Meinung nach liegst du falsch. Ich kann meine Position verteidigen.



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