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War die über 14.000 Jahre alte DNA, die „im Höhlenschmutz herumliegt“ vor Zersetzung geschützt oder ist sie von Natur aus so robust?

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In dem NYTimes-Nachrichtenartikel No Bones About It: Scientists Recover Ancient DNA from Cave Dirt habe ich gelesen:

Obwohl die DNA an Mineralien und verrotteten Pflanzen im Boden haftet, wussten die Wissenschaftler nicht, ob es jemals möglich sein würde, Zehntausende Jahre alte und tief unter anderem genetischen Schutt vergrabene Genfragmente herauszufischen.

Ich habe den Originalartikel noch nicht gelesen, aber ich möchte noch einmal überprüfen, ob es sich um nackte DNA-Moleküle handelt, die an Mineralien oder anderem Detritus in 14.000 bis 550.000 Jahre altem verdichtetem Schmutz haften? Zumindest grob gesagt? Laienhaft ausgedrückt, einfach nur in einigen Höhlen herumliegen?

Hat etwas die DNA vor Abbau geschützt oder ist DNA einfach umweltstabiler und robuster als ich dachte?

Diskussionen gibt es auch im Wissenschaftskommentar No bones? Kein Problem: DNA, die in Höhlenböden zurückgeblieben ist, kann uralte menschliche Bewohner enthüllen.

In dem Artikel der NYTimes heißt es weiter:

Die neue Studie umfasste die Suche nach alter DNA in vier Höhlen in Eurasien, in denen Menschen vor 14.000 bis 550.000 Jahren gelebt haben.

Dr. Meyer und seine Kollegen fanden heraus, welche DNA im Höhlensediment prähistorisch war, indem sie an den Enden der Moleküle nach verräterischen Abbauspuren suchten.

Was sind die "verräterischen Zeichen des Abbaus an den Enden" von DNA-Molekülen, die in der Arbeit beschrieben werden?


Um es klar zu sagen, sie finden keine langen DNA-Stränge, sondern kurze Fragmente. DNA wird robuster, je kürzer sie wird. Fragmente können Millionen von Jahren überdauern. Die lokalen chemischen Bedingungen haben einen großen Einfluss darauf, wie lange die DNA der ältesten unter idealen Bedingungen Hunderte Millionen Jahre alt ist.

Diejenigen, die die Archäologen finden, reichen nicht einmal annähernd aus, um einen intakten Strang wieder aufzubauen, aber er kann zum Abgleichen verwendet werden. Natürlich ist die Kontamination ein großes Problem, alles, was stirbt, hinterlässt DNA im Boden. Beim Menschen wird es besonders problematisch, da die Archäologen selbst eine wesentliche Kontaminationsquelle darstellen.

Einen tieferen Einblick in die zum Teil noch fragwürdigen Kontaminationsprotokolle finden Sie hier. Tut mir leid, es ist hinter einer Bezahlschranke.

Wahrscheinlich beziehen sie sich auf die Desaminierungs-Cytosin-Substitution, die fehlgepaarte DNA-Paare erzeugt und mit zunehmendem DNA-Alter immer häufiger auftritt.